อาหารปราศจากกลูเตนสำหรับ IBS หลายคนที่เป็นโรค IBS จะรายงานว่าอาการดีขึ้นเมื่อพวกเขา กำจัด กลูเตนออกจากอาหาร แม้ว่าพวกเขาจะไม่มีโรค celiac ก็ตาม 5กลูเตนเป็นโปรตีนที่พบในอาหารที่มีธัญพืช เช่น ข้าวสาลี ข้าวไรย์ และข้าวบาร์เลย์ อาการลำไส้แปรปรวน ความคิดที่ว่ากลูเตนมีบทบาทใน IBS เป็นเรื่องที่ต้องถกเถียงกัน ในแง่หนึ่ง มีนักวิทยาศาสตร์ที่โต้แย้งว่า IBS เป็นรูปแบบหนึ่งของความไวต่อกลูเตนที่ไม่ใช่ซีลิแอกซึ่งเป็นโรคที่เข้าใจได้ไม่ดีนัก คล้ายกับซีลิแอกที่กลูเตนเป็นตัวกระตุ้นอาการทางระบบทางเดินอาหาร 6คนอื่นแย้งว่า FODMAP fructanเป็นปัญหามากกว่ากลูเตน